وشغل بقائي عددا من المناصب القيادية في وزارة الخارجية الايرانية، بما في ذلك مساعدا لوزير الخارجية، وسفير ومبعوث ايران الدائم لدى مكتب الأمم المتحدة في جنيف خلال الأعوام 2018 الى 2022م.